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16 documentos marcados com "virulence"

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abricate

Triagem em massa de contigs para genes de resistência antimicrobiana e virulência.

abricate_run

Triagem em massa de contigs para genes de resistência antimicrobiana e virulência.

agrvate

Determine o tipo de locus agr e variantes do operon em Staphylococcus aureus.

agrvate

Identificar o tipo de locus agr e variantes do operon em Staphylococcus aureus.

amrfinderplus_run

Identifique genes de resistência antimicrobiana e virulência em sequências de genes ou proteínas.

ariba

Identifique genes rapidamente criando montagens locais a partir de reads paired-end.

ariba_getref

Baixe e prepare bancos de dados de referência para análise com ARIBA.

ariba_run

Identificar genes por montagem local de reads.

btyper3

Tipagem e caracterização in silico de genomas do grupo *Bacillus cereus*.

emmtyper

Tipagem *emm* de montagens de *Streptococcus pyogenes* (Estreptococo do Grupo A).

kleborate

Genotipagem e triagem de montagens de genoma de *Klebsiella*.

kleborate

Ferramenta de genotipagem para Klebsiella pneumoniae e seu complexo de espécies relacionadas.

merlin

MinER assisted species-specific bactopia tool seLectIoN.

shigapass

Prever sorotipos de Shigella e diferenciar Shigella/EIEC.

shigeifinder

Sorotipagem de Shigella e EIEC a partir de montagens.

stecfinder

Sorotipo de E. coli produtora de Shiga toxina usando reads/montagens.