abricate
Triagem em massa de contigs para genes de resistência antimicrobiana e virulência.
Triagem em massa de contigs para genes de resistência antimicrobiana e virulência.
Triagem em massa de contigs para genes de resistência antimicrobiana e virulência.
Determine o tipo de locus agr e variantes do operon em Staphylococcus aureus.
Identificar o tipo de locus agr e variantes do operon em Staphylococcus aureus.
Identifique genes de resistência antimicrobiana e virulência em sequências de genes ou proteínas.
Identifique genes rapidamente criando montagens locais a partir de reads paired-end.
Baixe e prepare bancos de dados de referência para análise com ARIBA.
Identificar genes por montagem local de reads.
Tipagem e caracterização in silico de genomas do grupo *Bacillus cereus*.
Tipagem *emm* de montagens de *Streptococcus pyogenes* (Estreptococo do Grupo A).
Genotipagem e triagem de montagens de genoma de *Klebsiella*.
Ferramenta de genotipagem para Klebsiella pneumoniae e seu complexo de espécies relacionadas.
MinER assisted species-specific bactopia tool seLectIoN.
Prever sorotipos de Shigella e diferenciar Shigella/EIEC.
Sorotipagem de Shigella e EIEC a partir de montagens.
Sorotipo de E. coli produtora de Shiga toxina usando reads/montagens.