40 documentos marcados com "typing"

Determine o tipo de locus agr e variantes do operon em Staphylococcus aureus.

Tipagem e caracterização in silico de genomas do grupo *Bacillus cereus*.

Classificação taxonômica in silico de genomas do grupo Bacillus cereus.

Determine o filogrupo de isolados de Escherichia coli.

Prever filogrupos de Escherichia coli a partir de montagens de genoma.

Prever o sorotipo de *Escherichia coli* (antígenos O e H).

Tipagem *emm* de montagens de *Streptococcus pyogenes* (Estreptococo do Grupo A).

Execute todos os esquemas MLST disponíveis para uma espécie em uma montagem

Executa todos os esquemas MLST disponíveis para uma espécie contra uma montagem

Prever sorotipo de cápsula de *Haemophilus influenzae*.

Prever o sorotipo de *Haemophilus parasuis*.

Genotipagem e triagem de montagens de genoma de *Klebsiella*.

Tipagem baseada em sequência (SBT) in silico de *Legionella pneumophila*.

Prever sorogrupo de *Listeria monocytogenes*.

MinER assisted species-specific bactopia tool seLectIoN.

Tipagem Automática de Sequência Multi-Locus (MLST) de montagens genômicas.

Reconstrua e classifique plasmídeos a partir de montagens de genomas bacterianos.

Sorotipagem e Tipagem de Sequência Multi-Antígeno (MAST) de *Neisseria gonorrhoeae*.

Realize a tipagem de sequência multi-antígeno de Neisseria gonorrhoeae a partir de montagens de genoma.

Prever o sorogrupo O-antígeno de isolados de Pseudomonas aeruginosa.

Preveja sorogrupos de Pseudomonas aeruginosa a partir de montagens.

Prever o tipo de Proteína de Ligação à Penicilina (PBP) de montagens de *Streptococcus pneumoniae*.

Identifique tipos de replicons de plasmídeos em sequências bacterianas e montagens.

Identificar replicons de plasmídeos em montagens de genomas bacterianos.

Realizar tipagem capsular de Streptococcus pneumoniae a partir de dados NGS.

Identifica elementos SCCmec em genomas de Staphylococcus aureus.

Identificar elementos SCCmec em genomas de Staphylococcus aureus.

Prever sorotipos de Shigella a partir de montagens.

Sorotipo de Shigella a partir de reads Illumina ou Oxford Nanopore.

Prever sorotipos de Shigella a partir de reads ou montagens.

Prever sorotipos de Shigella e EIEC a partir de montagens.

Predição de sorovar de montagens de Salmonella.

Ferramenta de linha de comando do Salmonella In Silico Typing Resource.

Encontrando tipos spa em Staphylococcus aureus.

Predição de sorotipo de montagens de Streptococcus suis.

Prever sorotipos de Streptococcus suis a partir de montagens de genoma.

Tipagem de SCCmec baseada em primers para genomas de S. aureus.

Identificar elementos SCCmec em genomas de Staphylococcus aureus usando o método Staphopia.

Sorotipo de E. coli produtora de Shiga toxina usando reads/montagens.

Detectar resistência e linhagens de genomas de Mycobacterium tuberculosis.