bactopia_sketcher
Crie esboços genômicos e realize classificação taxonômica rápida.
Crie esboços genômicos e realize classificação taxonômica rápida.
Cria sketches genômicos e realiza classificação taxonômica rápida.
Preveja o tamanho do genoma e encaminhe amostras com base na classificação taxonômica.
Anotação rápida de genomas bacterianos.
Classificação taxonômica e estimativa de abundância.
Classificação taxonômica in silico de genomas do grupo Bacillus cereus.
Calcula a Identidade Nucleotídica Média (ANI) de genomas completos.
Calcular a Identidade Nucleotídica Média (ANI) entre genomas.
Classificação taxonômica com o Genome Taxonomy Database.
Classificação taxonômica de genomas bacterianos e arqueais usando GTDB-Tk.
Baixe e configure o banco de dados de referência do GTDB-Tk.
Classificação taxonômica e filtragem de hospedeiro de reads de sequência.
Calcule distâncias genômicas usando sketches MinHash.
Identifique espécies a partir de dados de montagem e reads usando distâncias Mash.
Perfil de amostras metagenômicas contra um banco de dados usando Sylph.
Realize classificação taxonômica e estime tamanhos de genomas bacterianos.