8 documentos marcados com "snp"

Detectar recombinação e construir uma filogenia livre de recombinação.

Detectar e filtrar regiões de recombinação em alinhamentos bacterianos.

Alinhamento core-SNP a partir das saídas do Snippy.

Gera alinhamento de SNPs do genoma core a partir das saídas por amostra do Snippy.

Chamada rápida de variantes haploides e alinhamento do genoma central.

Chamar variantes contra um genoma de referência usando Snippy.

Cria uma matriz de distância de SNP a partir de um alinhamento múltiplo de sequências.

Calcular distâncias SNP pairwise a partir de alinhamentos de sequências.