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Inferência de recombinação em genomas bacterianos.
Inferência de recombinação em genomas bacterianos.
Detectar e mascarar eventos de recombinação em filogenias bacterianas.
Classificação taxonômica com o Genome Taxonomy Database.
Classificação taxonômica de genomas bacterianos e arqueais usando GTDB-Tk.
Detectar recombinação e construir uma filogenia livre de recombinação.
Detectar e filtrar regiões de recombinação em alinhamentos bacterianos.
Inferência filogenômica eficiente usando Máxima Verossimilhança.
Construir árvores filogenéticas de máxima verossimilhança a partir de alinhamentos.
Construção rápida de árvores filogenômicas sem alinhamento.
Crie árvores filogenéticas usando distâncias Mash.
Realize análise de pan-genoma com filogenia de core-genome opcional.
Alinhamento core-SNP a partir das saídas do Snippy.
Cria uma matriz de distância de SNP a partir de um alinhamento múltiplo de sequências.
Calcular distâncias SNP pairwise a partir de alinhamentos de sequências.