18 documentos marcados com "assembly"

Triagem em massa de contigs para genes de resistência antimicrobiana e virulência.

Triagem em massa de contigs para genes de resistência antimicrobiana e virulência.

Detectar genes de resistência antimicrobiana e virulência.

Determine o tipo de locus agr e variantes do operon em Staphylococcus aureus.

Identificar o tipo de locus agr e variantes do operon em Staphylococcus aureus.

Encontre genes de resistência antimicrobiana e mutações pontuais.

Monte genomas bacterianos usando estratégias de reads curtos, reads longos ou híbridos.

Monte genomas bacterianos usando seleção automatizada de montador.

Anotação rápida e padronizada de genomas bacterianos e plasmídeos.

Avalie a completude da montagem do genoma usando ortólogos de cópia única.

Avalie a completude da montagem genômica usando BUSCO.

Busca sistematicamente por sistemas de defesa anti-fago.

Reconstruir e tipar plasmídeos a partir de uma montagem de genoma bacteriano.

Baixe arquivos de montagem e anotação do banco de dados Assembly do NCBI.

Baixe genomas bacterianos do banco de dados RefSeq do NCBI.

Ferramenta de Avaliação de Qualidade para Montagens de Genomas.

Avalie a qualidade da montagem usando QUAST.

Prever resistência antimicrobiana a partir de dados de proteínas ou nucleotídeos.