abricate
Triagem em massa de contigs para genes de resistência antimicrobiana e virulência.
Triagem em massa de contigs para genes de resistência antimicrobiana e virulência.
Triagem em massa de contigs para genes de resistência antimicrobiana e virulência.
Resumir os resultados do rastreamento do Abricate.
Identifique genes de resistência antimicrobiana usando AMRFinderPlus.
Detectar genes de resistência antimicrobiana e virulência.
Encontre genes de resistência antimicrobiana e mutações pontuais.
Identifique genes de resistência antimicrobiana e virulência em sequências de genes ou proteínas.
Baixe e indexe o banco de dados mais recente do AMRFinder+.
Identifique genes rapidamente criando montagens locais a partir de reads paired-end.
Baixe e prepare bancos de dados de referência para análise com ARIBA.
Identificar genes por montagem local de reads.
Gene Allele Mutation Microbial Assessment.
Atribua genótipos a genomas de Salmonella Typhi.
Prever resistência antibiótica a partir de reads de sequenciamento.
Prever os tipos de proteína de ligação à penicilina (PBP) de Streptococcus pneumoniae a partir de montagens de genoma.
Identificar replicons de plasmídeos em montagens de genomas bacterianos.
Prever resistência antimicrobiana a partir de dados de proteínas ou nucleotídeos.
Crie mapas de calor de presença/ausência de genes de resistência.
Prever resistência a antibióticos a partir de montagens.
Identifica elementos SCCmec em genomas de Staphylococcus aureus.
Identificar elementos SCCmec em genomas de Staphylococcus aureus.
Identificar elementos SCCmec em genomas de Staphylococcus aureus usando o método Staphopia.