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22 documentos marcados com "antimicrobial-resistance"

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abricate

Triagem em massa de contigs para genes de resistência antimicrobiana e virulência.

abricate_run

Triagem em massa de contigs para genes de resistência antimicrobiana e virulência.

abritamr

Identifique genes de resistência antimicrobiana usando AMRFinderPlus.

abritamr_run

Detectar genes de resistência antimicrobiana e virulência.

amrfinderplus

Encontre genes de resistência antimicrobiana e mutações pontuais.

amrfinderplus_run

Identifique genes de resistência antimicrobiana e virulência em sequências de genes ou proteínas.

ariba

Identifique genes rapidamente criando montagens locais a partir de reads paired-end.

ariba_getref

Baixe e prepare bancos de dados de referência para análise com ARIBA.

ariba_run

Identificar genes por montagem local de reads.

gamma

Gene Allele Mutation Microbial Assessment.

genotyphi

Atribua genótipos a genomas de Salmonella Typhi.

mykrobe

Prever resistência antibiótica a partir de reads de sequenciamento.

pbptyper

Prever os tipos de proteína de ligação à penicilina (PBP) de Streptococcus pneumoniae a partir de montagens de genoma.

plasmidfinder

Identificar replicons de plasmídeos em montagens de genomas bacterianos.

rgi

Prever resistência antimicrobiana a partir de dados de proteínas ou nucleotídeos.

rgi_heatmap

Crie mapas de calor de presença/ausência de genes de resistência.

rgi_main

Prever resistência a antibióticos a partir de montagens.

sccmec

Identifica elementos SCCmec em genomas de Staphylococcus aureus.

sccmec

Identificar elementos SCCmec em genomas de Staphylococcus aureus.

staphopiasccmec

Identificar elementos SCCmec em genomas de Staphylococcus aureus usando o método Staphopia.