blast_blastn
Pesquise um banco de dados de nucleotídeos usando uma consulta de nucleotídeos.
Pesquise um banco de dados de nucleotídeos usando uma consulta de nucleotídeos.
Pesquise um banco de dados de proteínas usando uma consulta de proteína.
Pesquise um banco de dados de proteínas usando uma consulta de nucleotídeos traduzida.
Pesquise um banco de dados de nucleotídeos traduzido usando uma consulta de proteína.
Pesquise um banco de dados de nucleotídeos traduzido usando uma consulta de nucleotídeos traduzida.
Pesquise um banco de dados de nucleotídeos usando sequências de consulta de nucleotídeos.
Busca sequências de proteínas em banco de dados de proteínas.
Traduz sequências nucleotídicas e pesquisa em banco de dados de proteínas.
Inferência de recombinação em genomas bacterianos.
Identificação, classificação e anotação de correspondências de genes traduzidos.
Detectar recombinação e construir uma filogenia livre de recombinação.
Construa um pan-genoma a partir de anotações GFF3 usando Panaroo.
Realize análise de pan-genoma com filogenia de core-genome opcional.
Construa um pan-genoma a partir de anotações GFF3 usando PIRATE.
Análise rápida de pan-genoma de procariotos em larga escala.
Construa um pan-genoma a partir de anotações GFF3 usando Roary.
Alinhamento core-SNP a partir das saídas do Snippy.
Gera alinhamento de SNPs do genoma core a partir das saídas por amostra do Snippy.
Chamada rápida de variantes haploides e alinhamento do genoma central.
Cria uma matriz de distância de SNP a partir de um alinhamento múltiplo de sequências.
Calcular distâncias SNP pairwise a partir de alinhamentos de sequências.
Pesquisa sequências de consulta proteicas contra banco de dados de nucleotídeos.
Traduz sequências de nucleotídeos e pesquisa em banco de dados de nucleotídeos.