bactopia-workflows
Exibe o caminho para o arquivo main.nf de um fluxo de trabalho do Bactopia.
Uso
bactopia-workflows UNKNOWN [OPTIONS]
Argumentos
| Argumento | Tipo | Obrigatório | Descrição |
|---|---|---|---|
UNKNOWN | UNPROCESSED | Não |
Opções Obrigatórias
| Opção | Tipo | Padrão | Descrição |
|---|---|---|---|
--bactopia-path | STRING | Diretório onde o repositório do Bactopia está armazenado |
Opções Relacionadas ao Fluxo de Trabalho
| Opção | Tipo | Padrão | Descrição |
|---|---|---|---|
--wf | STRING | bactopia | Constrói um ambiente para o fluxo de trabalho especificado |
--list_wfs | BOOL | false | Lista os fluxos de trabalho disponíveis do Bactopia e encerra |
Opções Adicionais
| Opção | Tipo | Padrão | Descrição |
|---|---|---|---|
--verbose | BOOL | false | Exibe texto relacionado a depuração |
--silent | BOOL | false | Apenas erros críticos serão exibidos |
--version, -V | BOOL | false | Exibe a versão e encerra. |