bactopia-teton-prepare

Prepare sample sheets para análise downstream no fluxo de trabalho Teton.

Uso

bactopia-teton-prepare PREFIX SIZEMEUP RUN_TYPE FASTQS OUTDIR [OPTIONS]

Argumentos

Argumento	Tipo	Obrigatório	Descrição
PREFIX	STRING	Sim	Prefixo a ser usado para os arquivos de saída.
SIZEMEUP	STRING	Sim	A estimativa de tamanho de genoma do SizeMeUp.
RUN_TYPE	STRING	Sim	O tipo de execução de entrada (ex: paired-end, single-end, ont).
FASTQS	STRING	Sim	Lista separada por vírgulas de nomes de arquivos FASTQ.
OUTDIR	STRING	Sim	O diretório de saída para os resultados.

Opções

Opção	Tipo	Padrão	Descrição
--version, -V	BOOL	false	Exibe a versão e encerra.