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bactopia-sysinfo

Auto-detect a RAM e CPUs do host, emite fragmentos de CLI do Nextflow para perfis locais.

Lê o argv do wrapper do bactopia como passagem. Emite para stdout as flags adicionais --max_memory <N>.GB / --max_cpus <N> que devem ser adicionadas à linha de comando nextflow run. Não emite nada quando:

  • uma configuração personalizada é fornecida (-c ou --nfconfig)
  • qualquer valor de -profile não está na lista de permissões do executor local
  • tanto --max_memory quanto --max_cpus já estão definidos pelo usuário
  • a invocação é informacional (--help, --help_all, --list_wfs)

Uso

bactopia-sysinfo ARGS [OPTIONS]

Argumentos

ArgumentoTipoObrigatórioDescrição
ARGSUNPROCESSEDNão

Opções

OpçãoTipoPadrãoDescrição