bactopia-datasets
Baixe conjuntos de dados opcionais para complementar suas análises com Bactopia
Uso
bactopia-datasets UNKNOWN [OPTIONS]
Argumentos
| Argumento | Tipo | Obrigatório | Descrição |
|---|---|---|---|
UNKNOWN | UNPROCESSED | Não |
Opções Obrigatórias
| Opção | Tipo | Padrão | Descrição |
|---|---|---|---|
--bactopia-path | STRING | Diretório onde o repositório do Bactopia está armazenado |
Opções Relacionadas ao Download
| Opção | Tipo | Padrão | Descrição |
|---|---|---|---|
--datasets_cache | STRING | /home/rpetit3/.bactopia | Diretório base para baixar os conjuntos de dados (padrão para a variável de ambiente BACTOPIA_CACHEDIR; uma subpasta chamada datasets será criada) |
--force | BOOL | false | Forçar a substituição de ambientes pré-construídos existentes |
--max_retry | INT | 3 | Número máximo de tentativas para criar o ambiente Conda. (Padrão: 3) |
Opções Adicionais
| Opção | Tipo | Padrão | Descrição |
|---|---|---|---|
--verbose | BOOL | false | Exibir texto relacionado a depuração |
--silent | BOOL | false | Apenas erros críticos serão exibidos |
--version, -V | BOOL | false | Exibir a versão e sair. |