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bactopia-bracken-to-excel

Escreve as abundâncias do Bracken em um arquivo Excel.

Uso

bactopia-bracken-to-excel PREFIX BRACKEN_ABUNDANCES [OPTIONS]

Argumentos

ArgumentoTipoObrigatórioDescrição
PREFIXSTRINGSimPrefixo a ser usado para os arquivos de saída.
BRACKEN_ABUNDANCESSTRINGSimA saída do Bracken com as abundâncias.

Opções

OpçãoTipoPadrãoDescrição
--version, -VBOOLfalseExibe a versão e encerra.
--limitINT5Limita o resultado às N primeiras linhas.
--include_unclassifiedBOOLfalseInclui resultados para reads não classificadas.