Desenvolvedores
Esta seção fornece documentação de referência detalhada para os componentes individuais que compõem os fluxos de trabalho do Bactopia.
Referência CLI
Referência completa de linha de comando para todos os comandos do Bactopia e suas opções.
Plugin nf-bactopia
Referência para desenvolvedores do plugin Nextflow nf-bactopia -- funções utilitárias e operadores usados nos fluxos de trabalho do Bactopia.
Ver documentação do nf-bactopia
AI Skills
Habilidades de automação que orquestram comandos CLI do Bactopia por meio de ferramentas de codificação assistidas por IA para tarefas de scaffolding, manutenção, revisão e testes. Há 12 habilidades disponíveis.
Subworkflows
Subworkflows orquestram múltiplos módulos em unidades de análise reutilizáveis. Há 86 subworkflows disponíveis.
Módulos
Módulos são processos individuais que executam tarefas de análise específicas. Há 97 módulos disponíveis.