Bactopia Pipelines

Bactopia Pipelines são pipelines de análise completos construídos a partir dos subworkflows e módulos do Bactopia. Há 3 pipelines disponíveis.

Pipeline	Descrição
cleanyerreads	Controle de qualidade e remoção opcional de reads do hospedeiro a partir de reads de sequenciamento brutos.
staphopia	Pipeline de análise abrangente para isolados de Staphylococcus aureus.
teton	Classificação taxonômica e perfilamento de abundância de reads metagenômicos.